超微粉碎機在醫藥上有很多的應用，特別是對中草藥的應用就更普遍了，這也會存在各種問題，處理超微粉碎機的不足需要以下幾點。
，需要符合GMP的要求，材質是采用允許的不銹鋼，才可以使用。
第二，超微粉碎機在不加冷卻系統在連續運轉情況下，溫度也是有要求的，生產的粉末不會超過50度，低溫度可以達到零下35度。
第三，超微粉碎機的粉碎率要100%的或者是幾乎沒有損耗的，也沒有粉塵溢出。
第四，在生產工藝上，以粉碎至細胞級微粉。
第五，在中藥粉碎上，對于強纖維性、樹脂類、動物類、高糖高粘性等中藥，是可以解決這些中藥粉碎的。
